在艾米塔吉博物館的驚險救援，以及「蒙娜麗莎」神祕失竊案之後已經過了兩年，動物英雄們過著平靜卻略顯乏味的日子。然而，這份平靜即將被打破。
某天，老鼠莫瑞斯意外發現一卷記載著通往「埃及精靈」的地圖，於是，莫瑞斯與成為兩隻調皮小貓父母的文森與克莉歐佩特拉，將踏上埃及尋找精靈的旅程。為了搶先實現自己的願望，這群曾經並肩作戰的夥伴開始彼此競爭，從壯麗的金字塔到神祕的盧克索隧道，展開一場刺激又充滿危機的冒險。然而，當真正的危險逼近，他們將再次攜手合作，最終明白——當擁有友情和團隊精神時，根本不需要精靈來實現願望。金獎最佳動畫片續集《喵喵博物館2：埃及寶藏》團隊全新再升級，即將開啟神秘新篇章。